国家中医重点专科13项：推拿科、血液科、康复科、妇科、护理学、针灸科、脾胃病科、风湿科、脾胃病科、肾内科、皮肤科、急诊科、耳鼻喉科。
上海市第三批中医临床优势专科（专病）建设项目3项：骨伤科、肛肠科、乳腺癌。
上海市中西医结合重点病种建设项目2项：泌尿系统结石、代谢综合征。
同时医院积极扶持有中医药特色，具有发展潜力的临床专科，设立院级临床重点专科专病，给予专项建设经费，鼓励其持续发展，目前我院立项建设院级重点专科有：
院级重点专科、专病22个：肛肠科、肾病科、风湿科、乳腺病科、大肠外科、医学影像科；骨质疏松症、慢性阻塞性肺炎、脓毒症肺炎型、慢性疲劳综合症、高血压、前列腺病、脑垂体瘤、癫痫、小儿哮喘、甲状腺疾病、胃癌、下肢动脉粥样硬化、疼痛、冠状动脉粥样硬化、脑出血、卒中病单元。