中西医结合临床研究所为上海市中医药研究院附设性机构，依托上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院建立，是国家中医药管理局重点学科中西医结合临床学科的建设团队，是上海市中西医结合高原学科建设的重要单元之一，是上海市高校重点实验室建设项目承担单位之一，也是中西医结合临床专业硕博士培养点。由中国中西医结合学会副会长、上海市中西医结合学会会长王文健教授担任所长，由东方学者(跟踪计划)、上海市优秀学术带头人、上海中医药大学讲席教授张腾教授担任常务副所长主持日常工作，东方学者(跟踪计划)、上海中医药大学讲席教授陈瑜教授担任实验室主任，是由多学科专业人员组成的研究团队。目前团队研究技术人员共9名，其中6人具有美国知名大学和研究机构研修经历。

　　中西医结合临床研究所研究团队组建于2010年，立足于临床，借助现代生命科学原理与技术，以深入阐释心脑血管疾病、代谢性疾病、眼底病及肿瘤等慢性疾病的发病机制与中医药作用机理、诠释中医药学理论的科学内涵、深化对人体生命活动和疾病防治规律的认识、充分突显中西医结合防病治病的独特优势为宗旨开展临床基础与转化研究。此外，团队还专注于中西医结合临床专业研究生高质量的医学研究技能及科学思路的培养，并为全院医生及研究生的医学研究提供技术指导和平台支撑。

　　目前研究所建设完善运行的技术平台有：分子医学实验平台，具有分子生物学、组织病理学、细胞生物学等实验功能，同时，研究所还建立了小动物临床前视网膜结构与功能分析平台。综合的平台支持多种细胞生物学、分子生物学、病理学及相关学科药理学实验研究的开展。

　　分子生物学技术平台：自动核酸抽提，组织、细胞核酸和蛋白常规抽提，核酸和蛋白浓度测定，Real-Time PCR检测mRNA和miRNA表达,Western blot检测蛋白表达,凝胶成像系统，酶标仪系列(吸收光、化学发光、荧光分析)，荧光素酶报告基因分析系统，钙离子浓度测定。

　　组织病理学技术平台：石蜡切片，冰冻切片，H&E染色，各种特殊染色(三色染色、天狼星红染色、油红O染色、铁染色等)，免疫组织化学，原位细胞凋亡，显微成像系统，图像分析统计等实验。

　　细胞生物学平台：细胞培养系统，倒置显微成像系统，高通量、实时动态细胞学检测平台，细胞周期、凋亡等的流式细胞术分析检测。

　　小动物视网膜结构与功能分析平台：非侵入性活体眼底成像、光学相干断层扫描及视网膜电流图。

　　近五年，团队成员获各级人才项目14项，国家级课题8项(国家自然科学基金项目7项)，团队成员共发表SCI收录论文31篇，其中第一/通讯作者论文27篇，影响因子5分以上收录7篇，10分以上2篇，Science Signaling封面文章1篇。出版专著8部，获国家发明专利授权6项，申报PCT专利1项，获各级科技奖7项。指导的研究生获得2015年上海市研究生优秀成果(学位论文)，获上海市优秀毕业生3人，上海中医药大学优秀毕业论文5人次。